【张鹤鸣告老辞官，朱由校选中的人又纷纷推辞，辽东的担子自然落在了代理兵部尚书王在晋的头上。
朱由校让他经略辽东、蓟镇等地，王在晋是个有担当的人，也不推辞，火急火燎地前往辽东。
辽东的局势已经岌岌可危，王在晋经过一番视察后分析，广宁一战，辽东已无险可守，即使收复广宁也只是一座孤城，明军无力收复辽东，到时候还是会被女真人重新夺取，何必空耗钱粮，不如以山海关为依托，积蓄实力，等到足以收复整个辽东之时，再一举收复整个辽东。
他认为现在的山海关存在很大的隐患，容易被女真人居高临下攻击，他建议另在八里铺筑一城，给山海关加个保险，重建山海关防御体系，使山海关成为真正的雄关，大明的“京师屏翰”。
王在晋的主张，得到张鹤鸣、蓟辽总督王象乾等人的大力支持，军中大佬都发话了，朝中的大臣们见状也纷纷支持。
然而，就在工程即将开始的时候，内阁首辅叶向高收到了一封举报信，就是这封信改变了接下来的历史走向。
递信的人是王在晋的手下，名叫袁崇焕，在信中极力反对王在晋的战略，他认为山海关体系纵深过短，无法起到有效的屏障作用，应该推到二百里外的宁远防守 。
叶向高接到信都懵了，他一个文官，根本不通军事，于是他找到负责兵部事务的大学士孙承宗商量。
孙承宗对此事十分重视，亲自跑到山海关视察了一圈，回来后就上书称王在晋无法胜任，朱由校下旨将王在晋调为南京兵部尚书。】
天启年间。
王在晋人都麻了，他没想到自己竟然栽到一个小人物手上。这小子竟然不经过自己，直接给内阁首辅写信，胆子是真肥啊！
王在晋直接招来袁崇焕，一拍桌案怒喝道：“袁崇焕，你好大的胆子，你知不知道你在做什么，你眼里还有没有我这个上官？”
“卑职问心无愧！何罪之有？”
袁崇焕一脸不服，他觉得自己做的没错，他不是没找王在晋商量过，奈何王在晋死心眼一门心思只想固守山海关，把他的话当放屁。
王在晋气笑了：“好好好，那我就和你论上一论，你可知辽东一年需要多少饷银，固守山海关可以为朝廷减少多少负担？训练多少军队！等到朝廷实力够了反攻辽东有何不可？”
袁崇焕扣了扣耳朵，嗤笑道：“您这话说的，那不如连山海关都放弃了，省的岂不是更多？”
“你放屁！本官跟你就事论事，你少在这跟本官胡搅蛮缠！”
王在晋的鼻子都气歪了。
“咱就是一个臭打仗的，不懂那些个道道，咱只知道山海关一失，京师再无险可守，到时候失去的怕不只是些许钱粮了！”
“我主张宁远筑城，就是为了增加一段缓冲，离京师越远，京师也就越安全。”
袁崇焕抬头直视王在晋的眼睛。
“糊涂！且不说筑城期间会不会被女真人偷袭，单单这城的位置就离山海关远，而离敌人近，一旦被围，根本不能及时支援。”
“能支援的也就是一旁的觉华岛，而觉华岛自保都是问题，根本无法支援宁远！为了一座城，耗尽国力，绝非上策！”
“当年太祖皇帝击败北元，主动放弃已经占领的辽西之地，将军民内迁，坚壁清野，二十余年间，大明积累力量，随后一举拿下整个东北，太祖尚且如此，难道你比太祖皇帝还厉害？”
王在晋为了反驳，不惜抬出了朱元璋这张虎皮。
“少拿太祖皇帝压我，此一时彼一时，当年都城在南京有纵深，即便失了辽东也无大碍，可如今呢？京师离山海关有多近，王大人不会不清楚吧！王大人激励阻挠卑职，莫非是别有用心？”
袁崇焕不怀好意地看了王在晋一眼。
“你！你！你！真是个棒槌！”
王在晋气的差点没背过气去，这王八蛋竟然怀疑他通敌！
缓了半晌，王在晋疲惫地摆了摆手：“算了，我不跟你吵了，这么吵下去也没用，谁对谁错，未来自会证明！”
【王在晋调走后，出乎朱由校的意料，他的老师孙承宗竟然主动要求去辽东，朱由校大喜过望，一是他对孙承宗的能力有信心，二来他毫不怀疑对方的忠心。
朱由校立即下令孙承宗全权处理辽东军务，努尔哈赤终于迎来了他的劲敌。
孙承宗一手打造了大纵深防御体系，体系分三个地带，最前面为宁锦防御地带，以宁远为基地，屯聚重兵，通过中间的堡垒连接锦州，构成宁锦防线。中间以山海关为中心，凭借山、海的天然屏障固守。最后是关内防御地带。
除了通晓军事，孙承宗还知人善任，裁撤了庸官逃将，晋升了袁崇焕、鹿善继、马世龙等勇猛善战的武将。
天启六年（1626年），努尔哈赤亲率八旗军进攻宁远，久攻不克，努尔哈赤也被炮击伤，不久后病亡。
第二年，皇太极再次领军南下进攻锦州，不克，转而进军宁远，再次铩羽而归。】
天启初年。
“哈哈哈！两次大捷！除了我的老师还能有谁做到？”
“朕找了这么久，终于找到了朕的于谦！”
朱由校一吐先前的不快，激动万分。
“恭喜陛下，辽东有救了，孙师出马定可挽救辽东的颓势，拯救我大明。”
魏忠贤嘴上恭维，心中很是难受，无他，孙承宗是东林党人，跟他阉党根本不对付。
朱由校没有察觉的魏忠贤的不对，兴奋道：“赶快传老师来见我，不，我去亲自见他老人家！”
“我要让他管辽东军事，有他在，辽东乱局会解决。”
魏忠贤彻底慌了：“陛下，是不是有些着急了，要不先让熊廷弼试试？”
“熊廷弼？”朱由校陷入沉思，熊廷弼也不是不行，要是没有王化贞在，他未必不能击败后金。
有了！朱由校眼睛一亮：“那就两人都去，孙承宗作主，熊廷弼辅佐，这不就解决了么！”
“来人，传令给熊廷弼，至于老师那我亲自去！”
魏忠贤简直比死了都难受，陛下心意已决，无法阻拦，这以后日子怕是难过喽。