秦明率领大军从青州出发，浩浩荡荡地向清风山进发。他在离山十里的地方安营扎寨，准备第二天一早便发起进攻。夜幕降临，营地内灯火通明，士兵们磨刀霍霍，士气高昂，只待天明一战。清风山上的花荣也得到了消息，知道敌人来势汹汹，不敢怠慢，连夜召集手下商议对策，并布置好了伏兵，静待敌军到来。
次日清晨，阳光洒满大地，两军终于在清风山下相遇。只见一边是秦明身披铠甲、手持长枪，威风凛凛地站在阵前；另一边则是花荣带领着一众喽啰兵严阵以待。空气中弥漫着紧张而凝重的气息，大战一触即发。
随着一阵鼓声响起，双方几乎同时冲出阵营，瞬间交织在一起展开了激烈的厮杀。然而，在这混乱之中，两位主将却格外引人注目——秦明与花荣不约而同地脱离了各自的队伍，来到了战场中央进行单挑。只见两人你来我往，刀光剑影间碰撞出无数火花，足足打了几十个回合仍难分胜负。正当此时，花荣突然抽出弓箭，“嗖”的一声射出一箭，正中秦明头盔上的红缨。并未造成实质性伤害，这突如其来的变故还是让秦明大吃一惊，连忙勒马后退，暂时停止了追击。
趁着这个机会，清风山上的人马迅速撤退到了安全地带。看到这一幕，本就性格急躁的秦明哪里肯轻易放过？他立刻命令手下继续前进，试图一举拿下整个山脉。这是宋江和花荣事先设下的圈套之一。当秦明带着疲惫不堪的士兵进入山区后，他们发现自己仿佛进入了迷宫一般，四周都是密林深谷，道路曲折蜿蜒。更糟糕的是，每当他们认为找到了出口时，总会有新的障碍出现在眼前，使得行进速度越来越慢，体力消耗极大。
直到天色完全暗下来之后，这场猫捉老鼠的游戏才终于达到了高潮。宋江早已在山谷底部挖好了一个巨大的陷阱，用沙袋等物将其掩盖得严严实实。当最后一批追兵踏入其中时，只听“轰隆”一声巨响，地面突然塌陷下去，无数士兵措手不及之下纷纷跌入水中。紧接着，预先被拦截起来的溪流也被放开闸门，汹涌澎湃地冲刷过来，瞬间将许多人淹没于波涛之下。作为指挥官的秦明本人，因为过于深入敌境而在慌乱中迷失方向，最终也不幸落入了这个精心设计的圈套之中，成为了俘虏。
秦明被擒后，清风山的众位头领纷纷前来劝说他归降梁山。秦明身为朝廷将领，心中自有一股傲气和忠诚，对于背叛朝廷、加入草寇行列的想法，他一时难以接受。坚决表示不愿意归顺。
见秦明如此固执，清风山的众头领并未放弃，他们知道秦明性格豪爽，喜欢直来直去，便决定用另一种方式来打动他。他们留秦明在山上吃酒，企图用美酒和兄弟情谊来软化他的心防。秦明本就是个嗜酒如命的人，加之心情郁闷，便借酒消愁，一杯接一杯地喝下去，最终喝醉了，在山上睡了一晚。
第二天，秦明醒来后，发现自己身处清风山，心中不禁一阵懊悔。他急忙告别众头领，回青州复命。当他走到城外时，却发现城外许多人家都被烧成瓦砾场，一片狼藉。秦明心中一惊，暗想这难道是梁山贼寇所为？
他准备入城时，却被慕容知府拦住。慕容知府不仅不放他入城，还指责他“命人杀人放火”，并声称已处决了他一家老小。秦明闻言，如遭雷击，他无法相信自己的耳朵，无法接受这残酷的现实。他愤怒地质问慕容知府，得到的只是冷漠的回应和箭雨的洗礼。
秦明没办法，只得回旧路，却在路上遇到了宋江等人。回到清风山上后，他才知道原来这一切都是宋江等人为了断他的归路，让他入伙而派人扮作他在城外烧杀抢掠。秦明听后，愤怒之余便打算动手，但转念一想，自己如今已是孤家寡人，斗不过对方，他也深知“上界星辰契合”的道理，表示愿意归顺。
宋江见秦明终于答应了归顺，心中大喜。知道秦明是个重情重义的人，为了给他赔罪，便将花荣之妹花宝燕嫁给秦明为妻。此后，秦明更加坚定地站在了梁山一边，他亲自到清风寨说服徒弟黄信归降，又助宋江等人打进清风寨，杀了刘高一家老小。
梁山军队浩浩荡荡地攻打祝家庄之际，秦明被分在第二拨下山的队伍中，肩负着攻坚拔寨的重任。随着天亮的到来，他与宋江、花荣等第一拨人马成功会合，一同驻扎在村口。
当黄信在夜间侦查时不慎被俘的消息传来，整个营地陷入了紧张的气氛之中。为了确保营寨的安全，宋江决定留下秦明和林冲两位猛将把守。秦明心中焦急，但他知道此时更需冷静应对。
不久，庄后传来了激烈的厮杀声，打破了夜的宁静。秦明闻讯，毫不犹豫地率军前去救援。他挥舞着狼牙棍，英勇无比，与祝龙展开了激战。两人斗了十回合，祝龙便渐渐不敌秦明的勇猛。栾廷玉挺身而出，接替祝龙上阵。秦明与栾廷玉斗了一二十合，依然不分胜败。
栾廷玉并非等闲之辈，他将秦明引至荒草地，利用地形优势设下了埋伏。秦明在酣战之中，不料战马被绊倒，自己也随之身陷祝家庄的重围之中。幸运的是，后来梁山军队攻陷了祝家庄，秦明才得以获救。
此后，宋江兵发高唐州，秦明再次作为前路先锋，与林冲、花荣等人并肩作战。面对高廉的妖法，众将一时不敌，秦明和吴用等人巧妙配合，夜间在土坡上埋伏高廉。当高廉来劫营时，秦明等人齐心协力，射伤了高廉，迫使其退兵。不久后，公孙胜回梁山协助破城，众人得胜回山。
在呼延灼率师攻梁山时，宋江再次调兵遣将。秦明率先带领军队下山，在平原旷野处布阵迎敌。天亮，他纵马执狼牙棍与韩滔交手二十余合，韩滔败相已现。次日，秦明站在五队先锋的中心位置时，呼延灼发动了连环马阵，导致黄信中箭受伤。这一变故让秦明痛心疾首。
徐宁归顺梁山后，秦明与花荣、孙立等人率领军队在山脚叫阵，成功击溃了呼延灼的连环马阵。秦明开路作先锋攻打青州。手执狼牙棍厉声高骂，迎战呼延灼。两人斗到四五十合依然不分胜败。秦明又与孙立、花荣等人扮作军士潜入城中将慕容知府一棍打死继而攻破青州。
之后宋江又发起了对华州的攻击。秦明与花荣等人并作先锋至少华山与宋江等人汇合并乘着夜色抵达华州城下待命。第二晚秦明等人在渭河渡口岸上埋伏了一夜准备给敌人一个措手不及的打击。秦明与花荣陪同宿元景上少华山与呼延一同率领军队取华州城再次取得了胜利。
晁盖不幸身亡后，宋江开始暂居梁山泊主之位，秦明则在忠义堂中位列第五。在宋江攻打大名府的战役中，秦明担任前军头领，率先与闻达、索超展开激烈对决。秦明与索超交战二十余合，双方势均力敌，难分胜负。就在此时，韩韬以弓箭精准射中索超左臂，索超无奈丢弃大斧，仓皇逃跑。
此役过后，秦明率军突破庾家墥，杀入飞虎峪，在关胜攻打梁山时，秦明与林冲并肩作战，共同对阵关胜。正当二人即将取得胜利之际，宋江出于爱才之心，想要收关胜为山寨头领，担心关胜阵亡，便鸣金叫二人退下。随后，秦明又与孙立一同击败了宣赞，为梁山再添胜绩。
在吴用策划攻打大名府时，秦明与欧鹏、邓飞、杨志组成第四队，杀入大名府，在宋江决定分五路进攻曾头市时，秦明与花荣、马麟、邓飞负责攻打南大寨。由于李逵中箭，他们不得不撤军。次日，秦明与史文恭对阵，不幸中枪受伤，只得回山养伤。直到大聚义前，秦明都在养伤之中。
梁山排座次时，秦明因其贡献卓越，排名第七，被封为“天猛星霹雳火秦明”，位列马军五虎将之三，与索超、欧鹏、邓飞一起镇守梁山正南旱寨。朝廷派遣陈宗善到梁山招安时，五虎将本有意杀掉李虞侯、张干办，最终未遂。随后，朝廷派遣童贯攻梁山，吴用布下四斗五方旗，秦明率正南红旗军出战，击杀陈翥，并与董平、索超杀入童贯阵中，众人回山献功。不久后，朝廷再次派遣高俅率十节度攻打梁山，秦明、关胜、呼延灼、张清四人活捉了韩存保。次日，秦明等人在柳树阴率红甲军冲出，杀死刘梦龙的大半军队，最后打败高俅，梁山众人接受招安。
招安后，秦明参与了征辽、征田虎、征王庆的全过程以及征方腊的前大半段战役。在征辽过程中，秦明与林冲、花荣、索超一同生擒了被张清用飞石打下马的阿里奇；征田虎时，他的狼牙棒被公孙胜施法与乔道清用法术操纵的钢枪在空中对战；征王庆时，他与“纪山五虎”之一的袁朗大战一百五十余合；征方腊时，他有杀对方将领凤仪等战绩。
在征讨方腊的过程中，秦明于青溪县界迎战方腊的皇侄方杰。二人酣战三十余合后，南军将领杜微见方杰不能取胜，从方杰背后闪出用飞刀砍向秦明。秦明因躲闪飞刀注意力分散被方杰趁机一戟刺死。
后来，宋江回京上表秦明皇上后，被追封忠武郎