话说自帝江等几个祖巫身死怀抱盘古之时，共工，这位祖巫，此刻竟不知为何陷入了极度的愤怒与悲伤之中。不知是因为兄弟妹妹死在他面前还是痛恨妖族，此刻他整个人处在癫疯状态，他的怒火燃烧着整个胸膛，仿佛要将整个洪荒世界都吞噬掉。
在那一瞬间，共工似乎下定了决心，不顾一切地向着不周山冲撞而去。只听得一声巨响，声势浩大，惊天动地，而他也在这一撞中，身死投入大地回归盘古怀抱，洪荒众生都被这声巨响震惊到呆在原地，众人都心中大惊，不周山这座顶天立地的神山竟然被祖巫共工硬生生地撞得拦腰折断！原本高耸入云、稳固无比的不周山瞬间崩塌，山巅处断裂开来，露出了巨大的缺口，而那个缺口裂缝很大。
这一撞，所引发的后果简直不堪设想！由于不周山的倒塌，九层天上的苍穹也被破开了一个硕大的洞口。原本高高在上、平静如镜的天空，此刻像是被撕裂开一道狰狞的伤口，天上，天河里的无尽溺水从这个洞口中汹涌而出，如同天河决堤一般，直直地往洪荒天地倒灌而下，落向洪荒大地。
这场突如其来的灾难让整个洪荒世界陷入了一片混乱和恐慌之中。大多数生灵都在往高山上奔走，祈求能躲过这场灾难，无数的山川河流被淹没，广袤的平原变成了汪洋大海，许多生命在洪水中苦苦挣扎，面临着身死道消的灭顶之灾。
就在这时，六大圣人已经察觉到了这场浩劫的发生，他们也都大惊失色，纷纷施展神通，救济洪荒天地众生，以大法力逼退洪水，又用大神通拾起被洪水冲走的生灵，然后以最快的速度赶到了事发现场。其中，女娲娘娘更是得到了鸿钧道祖的特别吩咐，赐下乾坤鼎，让她来填补天空破开的口子，以此补天，终结此次祖巫共工造成的灾难。
女娲娘娘见鸿钧赐下了乾坤鼎，从半空中接过落入手中，随后便毫不犹豫地从身上取出五彩神石投入乾坤鼎中，运用自身无上造化神力开始炼化这些神石。只见五彩光芒闪耀夺目，神石化作了炽热的液体。女娲娘娘手持乾坤鼎，小心翼翼地将这些液体倾注到苍穹之上的那个破洞处。
经过一番努力，终于成功地将苍穹修补完整。然而，新的问题又接踵而至——天空虽然已经补上，但由于之前的撞击太过猛烈，天地四极变得不再稳定，摇摇欲坠。
正当众人为此忧心忡忡之际，通天教主挺身而出。他一路疾驰来到北海之畔，找到了传说中的玄龟。通天教主晓之以理、动之以情，费尽口舌，以它后续投胎转世后收入截教门下才终于说服玄龟献出自己的四肢，化作四根擎天之柱，支撑起了摇摇欲坠的天地四极。
至此，天空得以完全修复，天地四极重新恢复稳定。天道有感于众人拯救苍生的无量功德，降下了大量的天道功德，对参与补天的众人予以分封奖赏。
在这场灾难中，菡芝仙因为提前知道不周山会被共工撞到，已经在他们还在大战之时就往这边赶去，现在正好赶上，也发挥了重要作用。她目睹溺水落入洪荒后造成的生灵涂炭惨状，心中悲痛不已。于是，她奋不顾身地投身于救援行动之中，凭借自己的法术救出了许多人族以及其他生灵。正因如此，菡芝仙也获得了一缕珍贵的天道功德。
而被救的人族对菡芝仙感激涕零，他们决定在人族祖地修建一座宏伟壮观的庙宇，以表达对她救命之恩的深深敬意与感恩之情。取名“慈悲道观，”称呼菡芝仙为慈悲妙善娘娘，这座庙宇金碧辉煌、气势恢宏，里面供奉着菡芝仙的神像，终年香火不断。
而在解救行动开始之前，菡芝仙就已经提前发出消息，召唤十二生肖前来共同参与拯救人族生灵。当危机解除后，人族同样没有忘记这十二位英勇无畏的生肖使者，将它们一并供奉在了菡芝仙的庙堂之上。
与此同时，在地府之中，收到菡芝仙传音的毗摩罗不敢怠慢，立刻带领着周乞和嵇康迅速展开行动。他们忙碌地穿梭于战场之间，小心翼翼地收起那些因战乱而怨死的魂魄，并仔细地收集起众多妖族和巫族的尸体。这些尸体对于日后的菡芝仙有用，所以叫他们收取好，留作以后待用。
随着天空中的漏洞终于被补上，这场惊心动魄的灾难暂时告一段落。然而，那曾经高耸入云的不周山如今却已然倒塌，山下依旧残留着不少巫妖两族的身影。其中，巫族的幸存者们最终被地府的平心娘娘所收容。一部分巫族族人留在了地府，成为地府力量的一份子；而另一部分则在刑天的率领下，怀着沉重的心情踏上归程，回到了传说中的盘古殿。
妖族中，因势力庞大且种类繁多。剩下的都已身上带伤，其中一部分妖族之人有幸被女娲娘娘收归其门下，从此踏上修仙问道之路；而另一些则凭借自身独特之处，受到了六位圣人的青睐。
老子圣人独具慧眼，相中了一头威猛无比、毛色青翠的兜牛妖，并将其驯化为自己的坐骑。此牛妖力大无穷，奔驰如风，驮着老子圣人云游四海，好不威风！
元始天尊同样眼光独到，眼光极高，他收下了一头模样奇特的四不像作为座驾。这头四不像集龙首、麒麟身、狮尾、鹿角于一身，不仅外形威武霸气，更拥有神奇的能力，助元始天尊驰骋天地之间。
通天教主亦不甘示弱，也挑选了一头实力强大的牛妖当作自己的坐骑。这头牛妖体型巨大，浑身散发着凶悍之气，跟随通天教主南征北战，立下赫赫战功。
至于西方的两位圣人，则收纳了一些资质稍逊但善于钻营的妖族。虽然他们在天赋上可能不如其他被选中者，但凭借机灵巧变之能，倒也在修行路上走出了属于自己的一番天地。
然而，并非所有妖族都愿意投身于六圣门下。有一部分妖族秉持着自由独立之志，在商羊和白泽的带领下毅然决然地远离中土，向着北方的俱芦洲迁徙而去。他们在那片广袤无垠的土地上繁衍生息，逐渐建立起属于自己的势力范围。
还有一部分妖族则选择拜入通天教主门下，期望能在这位豪爽大气的教主教导下修成正果。
当这些妖族的去向安排妥当之后，六位圣人又将目光聚焦在了一件绝世宝物——混沌钟之上。这混沌钟乃是先天至宝，威力无边，拥有颠倒乾坤、镇压天地之能。众人为了得到它，展开了一场激烈的争夺之战。
一时间，天空中法宝光芒闪耀，法术神通层出不穷。六位圣人各显身手，施展出自己最为厉害的招数，试图将混沌钟据为己有。然而，尽管众人竭尽全力，最终却仍然一无所获。
而后女娲收取遗落的妖皇和羲和身死后的灵宝，日精轮和月精轮，老子圣人收了屠巫剑，元始收了半截倒下的不周山，后续炼成了威力巨大的翻天印，其他圣人无所得。
就在众人激战正酣之时，那混沌钟突然绽放出一道耀眼夺目的光芒，随后便消失得无影无踪，仿佛好像从未出现过一般，众圣以为是被鸿钧圣人收走，无不感到可惜，这场六圣大打出手的争夺就此落下帷幕，留下了满脸不知所措的洪荒众生，而后六圣各归道场暂且不提。