赶到巨蟹宫的穆面前出现了哈迪斯的真正的冥斗士，他们追问撒加一行人的去向。原来撒加他们在与沙加的小宇宙直接冲突时产生的爆炸中不知所踪了。
在地暴星独眼人准备向穆发起进攻时，星矢出现了。但是，突然有人将二人的行动封住，这人正是地妖星缪。他认为撒加一定先去雅典娜所在之处，所以命令独眼人先去前面的狮子宫。缪在星矢面前现身，竟然是人类无法想象的一堆不定形物。穆对他发出攻击后突然变成了一条毒虫，并且从嘴里喷出了蚕丝，把穆赫星矢封进了茧中。然后缪把自己也包在了茧中，完成了最后的进化，穆让星矢先去狮子宫，自己一个人对付缪。面对冥界之蝶的缪，穆使用星光灭绝击败了缪，但缪却化身为冥界之蝶继续跟踪着穆等一行人。
在狮子宫前倒下的星矢，被随后赶来的紫龙、瞬、冰河叫醒。在去狮子宫的途中，他们发现了被剥去冥衣倒下的冥斗士。
到达狮子宫的冥斗士面前站的是被称为“黄金狮子”的艾欧利亚。感觉到冥斗士中有令人怀念的小宇宙而一时不知所措的艾欧利亚，被地伏星的莱米用虫足带捆住了。冥斗士顺利通过他身边向前进发。愤怒的艾欧利亚用强大的小宇宙葬送了莱米。通过狮子宫的冥斗士们来到了处女宫。但是他们被沙加强大的小宇宙玩弄于股掌之间。然而丘布等三名冥斗士却抵挡了沙加对冥斗士们毁灭性的攻击，后来明白原委的沙加将他们的冥衣打烂，露出了他们的本来面目。
剩下的冥斗士成了沙加的对手，地暴星以为在冥想中的沙加是在躲避战斗，全力攻击之余却被沙加的“天魔降服”轻松击败。把冥斗士们全部打倒后，沙加想问清楚撒加他们的真正心意，但得到的回答只是不惜一切代价要夺取雅典娜的首级。面对这三位最强的黄金圣斗士，领悟到死的沙加把他们带入了传说中的沙罗双树园，展开最后的战斗。沙加用最大奥义天舞宝轮将他们五感逐一剥夺。走投无路的三人只能使用神话时代以来就被雅典娜禁止使用的终极影之战法——雅典娜之惊叹。为了不使复活并为哈迪斯的走狗失去意义，他们宁愿承受污名使出了雅典娜之惊叹。之后，沙加在自己选择的沙罗双树园中化为星辰，临死前向雅典娜传达了重要的信息。
为了向雅典娜传达一切，留在园中的沙加用自己的血在沙罗双树的花瓣上写了什么，并把他们送到雅典娜所在的地方，然后他的灵魂就完全消失了。
返回处女宫的撒加等人面前所站的，是震怒的艾欧利亚。为了替沙加报仇，艾欧利亚发起了致命攻击。但是穆在一旁冷静的思考沙加死去的真正意义。这时，米罗也离开天蝎宫出现在这里。米罗知道沙加的死之后，也愤怒得向撒加等人发起了攻击。撒加一行人必须赶到雅典娜身边，所以准备再次使用雅典娜之惊叹。但是，穆、艾欧利亚和米罗也使出了雅典娜之惊叹。不相上下的雅典娜之惊叹如果有哪一方失去平衡的话，圣域就会毁灭。
雅典娜之惊叹的激战，因为力量平衡而进入僵持阶段，强大的小宇宙在处女宫不断膨胀。星矢等青铜圣斗士为了阻止一切的大爆发把自己的小宇宙上升到了最高极限。终于将雅典娜之惊叹推向天空消解。雅典娜知道了沙加死去的意义之后下定了决心，她命令穆等人将三人带来雅典娜神殿。并且，雅典娜把黄金短剑递给了撒加，让他杀了自己。撒加虽然知道雅典娜的心意，但始终无法对她下手，这时，雅典娜从撒加手中取过短剑，刺向自己的喉咙。
星矢等人为雅典娜之死而悲伤之时，史昂出现了，并且告诉他们，真正的战斗现在才开始。
史昂向星矢他们说出了沙加和雅典娜之死的真正意义，并且道明了全部真相。史昂手上沾满了神血，朝向雅典娜神像发出了召唤，因为这些血，雅典娜神像变成了女神的圣衣。为了女神的圣衣的复活，必须要女神自己的血，知道这一切的只有当时是教皇的史昂一人。为了这个目的，史昂借着哈迪斯的诱惑，趁机进入了十二宫。因为一直处在哈迪斯的监视之下，撒加他们只能隐瞒真相，甚至不惜使用雅典娜之惊叹。史昂用雅典娜的血使青铜圣衣复活，他以教皇的名义命令青铜圣斗士深入哈迪斯城，打倒哈迪斯。在哈迪斯城，拉达曼迪斯由于私自派出冥斗士到圣域，受到潘多拉的责罚。比星矢他们早一步到达哈迪斯城的穆等人受到了冥界三巨头之一的天猛星拉达曼提斯的攻击，无法前进。
这时，穿着全新圣衣的青铜圣斗士们出现了。
青铜圣斗士们勇敢地面对拉达曼提斯，但是穆却让他们去帮助撒加，自己来对付拉达曼提斯。与此同时撒加等三人假装带着雅典娜的遗体前来求见潘多拉，目的是为了打倒哈迪斯。然而却因为12小时短暂生命到期而失去力量。
得知雅典娜不顾生死前往冥界的消息，潘多拉放弃了哈迪斯城，赶回冥界。并将后事托付给地奇星哲洛斯。对于居然赶踩自己师傅的哲洛斯，后来赶到这里的冰河用极光处刑将其打下冥界。青铜圣斗士们在追赶前往冥界的潘多拉时发现了拉达曼提斯，而后者打败了穆等人。在拥有压倒性实力优势的拉达曼提斯面前，星矢等人也毫无办法。但是为了报答黄金圣斗士们的期望，为了把女神的圣衣送到冥界中等待的雅典娜手中，星矢继续燃烧自己的小宇宙至第八感，与拉达曼提斯一同掉进了冥界。
哈迪斯城开始崩溃，所有人都必须跳入冥界入口。正当紫龙、冰河及瞬准备跳下的时候，童虎出现并阻止三人。童虎说出要活生生的进入冥界，不受哈迪斯所支配，便要领悟第八感--阿赖耶识，沙加及沙织就是这样的进入了冥界。所以众人必须在跳下的时候领悟到第八感，接着四人一同跳下了通往冥界之门。星矢醒来后发现自己已经到达了冥界，连忙唤醒身旁的瞬，接着二人来到了冥界的入口——地狱门。穿过地狱门就是阿格戎河，这时渡河守护者冥斗士天间星卡隆出现。为了避免无谓的战斗，瞬愿意把挂在身上的珍贵吊饰摘下交给卡隆作渡河的旅费。二人便让卡隆载他们到河的对岸。在渡河的中途加路与星矢发生激战，及后当到达了第一狱的岸边后，星矢使出流星拳把卡隆打败。
星矢、瞬来到了第一狱的裁判庭。士兵马路基诺介绍说，由于守护第一狱的冥斗士，米诺斯的代行官路尼十分讨厌噪音，所以这个裁判庭是不许大声说话的。正当马路基诺惊慌失措的报告说有圣斗士入侵时，由于其大声说话，所以被路尼用鞭碎尸掉。接着路尼把星矢判到第六狱的第一谷血池地狱，不过被瞬的星云锁链所救。
突然路尼发觉瞬很像某一人，而且感到害怕起来，于是用巴理隆之鞭使出火焰绞绳，把瞬的身体四分五裂。不过这时瞬的头颅突然对路尼说话，路尼大惊下走出了法庭，遇到了拉达曼迪斯，开始发现原来是幻觉，而星矢及瞬则安然无恙。
当路尼发觉是幻觉的时候，加隆出现在他的面前，这时，路尼知道了自己是在第一狱中了加隆的幻觉拳，不过他很快被加隆消灭，全身粉碎。这时星矢及瞬也赶来，被加隆教训了一顿，接着要二人先行。拉达曼迪斯的绝技未能对加隆造成伤害，但是当加隆要使出幻胧魔皇拳的时候，一班冥斗士突然现身，通知拉达曼迪斯潘多拉要召见他，于是被拉达曼迪斯走脱。最后加隆以一招银河裂星拳把六名冥斗士一起干掉。
星矢及瞬通过了黑风谷，到达了第二狱，却遇上了有三个头的巨兽克洛贝斯，同时第二狱的守护者天兽星法拉奥出现了。星矢及瞬打晕了地狱守护犬克洛贝斯后受到了法拉奥的攻击，这时天琴座白银圣斗士欧路菲现身，阻止了法拉奥的攻击，但是却使出弦乐夜曲把星矢及瞬打倒，最后把二人带到一处盛开着鲜花的地方。
星矢及瞬苏醒后，看到眼前一名少女的下身变成了石头，不久她开始说话，说出了她与欧路菲的故事。原来她名叫尤莉迪丝，她本来是和欧路菲相爱的，不过后来被毒蛇咬了一口，中毒身亡。而欧路菲为了令她复活，所以来到冥界请求哈迪斯。由于欧路菲的琴音出色，令哈迪斯十分喜欢，便答应了他的请求，不过他们离开冥界的时候不可以回头。结果，法拉奥使了诈，在第二狱留住了他们二人。
欧路菲回来后不久，法拉奥也出现了，他还说出了当年令欧路菲留下的诡计。欧路菲大怒，以雅典娜圣斗士的身份开始战斗。
法拉奥把欧路菲最有攻击力的G弦线切断了，不过他的绝技均衡诅咒也被破解了。最后奥鲁弗斯把G弦线用牙拉直，使出弦乐夜曲打败了法拉奥。欧路菲利用每十三日弹琴给哈迪斯的机会，带同星矢、瞬一起对付哈迪斯。欧路菲把星矢及瞬藏在装满鲜花箱子里，然后带着二人来到了第八狱的终点朱狄加，到达大厅见到了潘多拉。不过潘多拉认为非常时期一定要先检验箱子，结果并未发现异样。当欧路菲正准备为哈迪斯演奏时，冥界三巨头天雄星艾亚哥斯、天猛星拉达曼提斯、天贵星米诺斯也来到了大厅。
面对冥界三巨头，欧路菲唯有奏出小夜曲令众人昏睡。但是正当欧路菲准备袭击布幕后哈迪斯时，受到拉达曼迪斯的攻击，原来拉达曼迪斯根本没有留心欣赏琴声。
这时，星矢及瞬从箱子中跳出来牵制着拉达曼迪斯，而欧路菲则冲向王座打开布幕，竟然看到哈迪斯的长相与瞬一模一样。当欧路菲使出弦乐终章的时候，哈迪斯的身体却消失了。欧路菲为了打倒拉达曼迪斯不惜牺牲自己的性命，不过拉达曼迪斯并未被打败。突然，瞬像是变成了另一个人呵斥拉达曼迪斯退下，瞬变成了哈迪斯！！
拉达曼提斯击败星矢后把星矢和欧路菲尸体扔进了冰地狱，潘多拉则安抚着哈迪斯。
加隆、紫龙和冰河来到了第三狱，冥斗士天角星洛克的滚动巨石被众人避开了，接着紫龙一招庐山升龙霸把洛克打败。在第三狱的出口又遇上了天败星，天败星连名字也未说出便被冰河的钻石星尘拳击倒了。来到第四狱黑暗沼泽，遇上了使着木筏的天罪星弗列基亚斯，弗列基亚斯不怕庐山升龙霸及钻石星尘拳，还使出地狱咆哮打倒二人，但是弗列基亚斯的地狱咆哮被加隆看穿已无效，加隆接着使出银河裂星拳把弗列基亚斯打败。
紫龙及冰河醒来时，原来已被加隆用木筏载到了第五狱，追上加隆的时候看到加隆已把天丑星打败。不过这时拉达曼迪斯突然出现，加隆命紫龙、冰河先走，自己留下对付拉达曼迪斯。开战不久，加隆的银河裂星拳已胜过了拉达曼迪斯的灰暗警告冲击波，可是另外俩名巨头艾亚哥斯及米诺斯也到来，加隆分别受到了二人的银河幻像及宇宙提线傀儡木偶攻击，情况十分危急，这时一辉突然赶到了冥界，出手救了加隆。在得知瞬的身体落入哈迪斯手中时，更扬言要按顺序打倒冥界三巨头。艾亚哥斯首当其冲与一辉接战，面对艾亚哥斯的神鹫飞翼，一辉第二次便看穿其绝技，将艾亚哥斯击倒在地。
这是冥界篇的前半段，哈迪斯出现，圣斗士也正式攻入了冥界。